Важнейшим направлением деятельности Национальной Ассоциации должна стать защита демократических ценностей, прав, свобод и законных интересов общества, а значит граждан нашей страны. Исходя из этого, Ассоциация призвана оказать всестороннюю поддержку демократизации общества, либерализации всех сфер общественной жизни, модернизации и реформированию страны.

Создание Ассоциации явилось поступательным шагом в построении свободного и открытого гражданского общества, упрочнении роли ННО в государственной и общественной жизни путем их консолидации, создания мощного конструктивного противовеса государственным структурам, гарантом баланса интересов в обществе.Для обеспечения реализации поставленной цели НАННОУз выполняет следующие задачи:

- оказывает всестороннюю поддержку различным ННО и содействует их деятельности, направленной на дальнейшую либерализацию и демократизацию общественной жизни, упрочение демократических ценностей, а также способствует повышению их роли во всех сферах жизни общества;
- консолидирует деятельность организаций “третьего сектора”, развивает сотрудничество между ними, участвует в обеспечении потребности ННО в надежной и достоверной информации, соответствующей информационной и научно-методической поддержки;
- мобилизует интеллектуальные, материально-технические и др. ресурсы ННО для реализации приоритетных программ и проектов общества;
- разрабатывает стратегию эффективного взаимодействия, обеспечивает участие ННО в процессе выражения и отстаивания интересов различных слоев общества, путем конструктивного диалога с государственными структурами власти и управления;
- обеспечивает действенный общественный контроль над государственными органами и должностными лицами, создает соответствующие условия для полноценного участия в этом процессе каждого гражданина нашего общества;
- оказывает содействие развитию программ ННО, направленных на воспитание чувства взаимопонимания, толерантности и патриотизма населения, уважения национально-культурных ценностей и традиций народов Узбекистана;
- оказывает содействие ННО в сотрудничестве со СМИ.

Созданная Ассоциация призвана представлять и защищать интересы тех ННО, которые менее всего пользовались поддержкой государства - самых уязвимых, но в тоже время самых активных и дееспособных, созданных по инициативе граждан.